พ.ศ. 2460 โรงเรียนย้ายที่ทำการไปอยู่ที่ถนนสุริยะประดิษฐ์ อำเภอเมืองจังหวัดนราธิวาส
ซึ่งตั้งอยู่หน้าบ้านพักผู้ว่าราชการจังหวัด และเป็นโรงเรียนนราสิกขาลัยในปัจจุบัน
พ.ศ. 2469 เริ่มยกเลิกชั้นประถมศึกษาและยกเลิกหมดในปี พ.ศ. 2471
พ.ศ. 2470 นักเรียนหญิงบางส่วนแยกไปเรียนที่โรงเรียนสตรีนราธิวาส
พ.ศ. 2476 เปิดสอนชั้นมัธยมสายสามัญต่อจาก ม.3 ส่วนชั้น ม.4 ฝึกหัดครูก็ยังมีอยู่ตามเดิม
พ.ศ. 2479 โรงเรียนเปิดสอนชั้น ม. 5
พ.ศ. 2480 มีนักเรียนฝึกหัดครูประกาศนียบัตรจังหวัด ย้ายจากอำเภอสุไหงปาดี จังหวัด
นราธิวาสมาเรียนรวมอยู่ในชั้น ม.4 และ ม.5 ด้วย
พ.ศ. 2483 เปิดสอนถึง ม.6 และนักเรียนหญิงชั้น ม.1 – ม.3 ไปเรียนที่โรงเรียนนราธิวาส
พ.ศ. 2486 แยกนักเรียนหญิงทั้งหมดไปเรียนที่โรงเรียนสตรีนราธิวาส
พ.ศ. 2490 นักเรียนหญิงทั้งหมดกลับมาเรียนที่โรงเรียนอีกตามคำสั่งจังหวัดนราธิวาส ที่ 748/2490 ลงวันที่ 4 สิงหาคม 2490 เรื่อง จัดการสอนเนื่องจากครูขาด
พ.ศ. 2494 นักเรียนหญิงทั้งหมดกลับไปเรียนที่โรงเรียนสตรีนราธิวาสตามเดิม
พ.ศ. 2503 ยุบชั้น ม.1 เพื่อปรับชั้นเรียนใหม่ ตามแผนการศึกษาแห่งชาติ พ.ศ. 2503
พ.ศ. 2504 ยุบชั้น ม.2 และเปิดชั้น ม.ศ. 1 (ม. 4 เดิม)
พ.ศ. 2505 ยุบชั้น ม.3 และเปลี่ยนชั้น ม. 5 เป็น ม.ศ.2 และเปิดสอนชั้นมัธยมศึกษา
ตอนปลายสายสามัญแผนกวิทยาศาสตร์ เป็นแบบสหศึกษา เริ่มชั้น ม.ศ. 4
พ.ศ. 2506 เปิดสอนชั้น ม.ศ. 1 – ม.ศ.5 ครบตามแผนการศึกษาแห่งชาติ พ.ศ.2503
พ.ศ. 2512 เข้าโครงการ คม.ช.รุ่นที่6
พ.ศ. 2513 เปิดสอนชั้นมัธยมศึกษาตอนปลาย สายสามัญ แผนกทั่วไป
พ.ศ. 2519 ย้ายนักเรียนชั้น ม.ศ.ไปเรียนที่อาคารเรียน หมู่ที่7 ถนนโคกเคียน ตำบลโคกเคียน
อำเภอเมือง จังหวัดนราธิวาส (สถานที่ตั้งโรงเรียนปัจจุบัน) ในปีนี้โรงเรียนจึงเปิดสอน โดยมีที่ทำการ 2 แห่ง
พ.ศ. 2521 โรงเรียนย้ายสถานที่ทำการมาจัดการศึกษาทั้งหมดในที่ปัจจุบัน โดยจัดแบบ
สหศึกษา และได้เพิ่มชั้น ม.1 โดยรับนักเรียนที่จบชั้น ป.6 มาเรียนเป็นปีแรก
พ.ศ. 2522 โรงเรียนเข้าโครงการการพัฒนาโรงเรียนมัธยมในส่วนภูมิภาค (คมภ.2) รุ่นที่ 4
โดยใช้เงินกู้จากธนาคารโลก ในปีนี้การจัดการศึกษาได้ยุบ ม.ศ.1 และเปิด ม.2
พ.ศ. 2523 ยุบชั้น ม.ศ. 2 และเปิดชั้น ม.3
พ.ศ. 2524 ยุบชั้น ม.ศ. 3 เปิดสอนชั้น ม.4
พ.ศ. 2525 ยุบชั้น ม.ศ. 4 และเปิดสอนชั้น ม.5
พ.ศ. 2526 ยุบชั้น ม.ศ. 5 และเปิดสอนชั้น ม.6
พ.ศ. 2542 มีการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างกระทรวงทำให้โรงเรียนเปลี่ยนจากสังกัด กรมสามัญศึกษา ไปสังกัดสำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน
พ.ศ. 2553 เปลี่ยนโครงสร้างจากเดิมซึ่งสังกัดสำนักงานเขตพื้นที่
การศึกษานราธิวาส เขต 1 สำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน
มาสังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษามัธยมศึกษา เขต 15 สำนักงาน
คณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน