ตราสถานศึกษา เป็นรูปเรือกอและที่กำลังกางใบ ซึ่งรูปคบเพลิงอยู่กลางใบกำลังแล่นฝ่าเกลียวคลื่น
เหนือดวงตราด้านบนมีอักษรภาษาไทยกำกับไว้ว่า “โรงเรียนนราธิวาส” และด้านล่างดวงตรามีคำว่า
“อ.เมืองฯ จ.นราธิวาส”

ความหมายของสัญลักษณ์

1. เรือกอและ    หมายถึง     พาหนะส่งผู้คนขึ้นฝั่ง

2. คบเพลิง       หมายถึง     การจุดประกายความคิดให้นักเรียนมองเห็นความสว่างในชีวิต

3. น้ำ              หมายถึง     สิ่งที่ทำให้ชีวิตชุ่มชื่น อันได้แก่

    น้ำใจ           ได้แก่        การเอื้อเฟื้อเผื่อแผ่ช่วยเหลือกัน

    น้ำคำ           ได้แก่        คำพูดที่ต้องสุภาพ ไพเราะ อ่อนหวาน

    น้ำแรง          ได้แก่        กำลังใจในการทำงาน

    น้ำพัก           ได้แก่        การพักจิตใจให้สงบ เพื่อมิให้เกิดความท้อถอยในการทำงาน

4. เกลียวคลื่น    หมายถึง     อุปสรรคที่ต้องฝ่าฟันเพื่อไปให้ถึงจุดหมายของชีวิตที่วางไว้